平常的 Preferences -> General -> Network Connections 中的代理是 Eclipse 软件本身的，对于运行时的代码无效。

需要对运行的代码设置代理，需要设置 jvm 的参数。在 Run -> Run Configurations 窗口中选择欲运行的文件，然后在其 Arguments -> VM arguments 中添加类似下面的代理信息：

不过这样设置的是单个文件的参数，至于如何给一个项目或全局设置代理就还没找到资料。

信息获取自Eclipse 编写应用程序设置代理。